洗眼器重要防护的位置便是人的皮肤以及眼睛，如果洗眼器所连接的水资源不够健康，那么反而会造成反效果。

水质也是冲淋过程中很重要的因素，若将受到污染或不干净的水通过洗眼器冲淋在人身上，反而可能造成更大伤害，更别说紧急救助之目的，因此确保水质干净卫生，是最基本的要求，事业单位应该使用如自来水等干净卫生水源，一般可连接至事业单位的供水系统，当然也可考虑连接更干净卫生的供水系统。若事业单位用水可能不够干净卫生，可能就需要另外设计供应系统，对于水质标准，建议至少达到饮用水之标准。

水质除了干净卫生外，也都有对于水温之建议手拉阀，避免水管内的水结冻，影响设备性能，这对温带、寒带地区较为重要，就南方地区(广东省)而言，一般室温应不会有结冻问题，除非事业单位有特殊之低温环境，不然建议不须考虑水温之问题。

供水系统设计之初，一般都能维持一定水质，但是若未适当维护，将可能使得水质受到污染或损坏，特别是这种备用性质之设备，因此建议应该定期检查维护，透过定期检查维护，让水能够流动，保持干净卫生的水质。过去研究曾发现，一段时间未使用之设备，水中出现铁锈、沙子等杂质，可透过水质要求及定期测试，避免此项缺失。

所以，不要忽视洗眼器所使用的水质情况，即使是普通的水管里头，长时间不用也会产生不干净的元素，所以测试也不要太过于马虎，认为眼睛看的干净就好，最关键的是要测试是否含有对人体有伤害的元素。